Σε αντίθεση με την κλασική ανάλυση DNA, η οποία απαιτεί γενετικό υλικό από κύτταρα με πυρήνα, η πρωτεομική γονοτυποποίηση εστιάζει στο πρωτεϊνικό προφίλ του στελέχους της τρίχας.
